System próżniowy wytwarza różnicę ciśnienia atmosferycznego między wnętrzem zbiornika a otaczającym go powietrzem, umożliwiając jego napełnianie lub opróżnianie. Wytworzenie próżni, a zatem podciśnienia, umożliwia zasysanie gnojowicy. W fazie rozlewania jest odwrotnie - ciśnienie wytworzone w zbiorniku powoduje wyrzucenie gnojowicy. A zatem przez pompę nie przepływa gnojowica, a jedynie powietrze.
Wybór wydajności (przepływu powietrza) pompy próżniowej jest ważnym krokiem w konfiguracji wozu asenizacyjnego. W fazie zasysania ważne jest to, że próżnia powstaje w ciągu jednej minuty. Logiczne zatem jest, aby w pierwszej kolejności wybrać pompę o natężeniu przepływu na minutę równym całkowitej pojemności zbiornika. Na przykład pompa, która może zassać 10 000 l powietrza na minutę nie tylko wytworzy próżnię w zbiorniku o pojemności 10 000 l w ciągu zaledwie 1 minuty, ale także utrzyma ją podczas całego procesu napełniania. Gdyby przepływ wynosił 5000 l/min, zajęłoby to co najmniej dwa razy więcej czasu. W fazie tłoczenia, a tym samym opróżniania, pompa musi jedynie dostarczyć do zbiornika wystarczającą ilość powietrza, aby równomiernie go opróżnić. Wybór pompy o zbyt wysokich parametrach wiąże się ze stratami siły napędu, a ponadto z ryzykiem przedwczesnego zużycia pompy. Poziom próżni pozostaje identyczny bez względu na rodzaj wybranej pompy.