Вакуумный насос создает разницу между атмосферным давлением внутри цистерны и снаружи, что позволяет заполнить или опорожнить её. Когда создается вакуум или разряженное пространство, жижа всасывается. На фазе нагнетания принцип противоположный: в цистерне насосом нагнетается давление, благодаря чему жижа выталкивается наружу. Таким образом, через насос проходит не навоз, через а только воздух.

Режим насоса 1 000 об/мин (прямой привод от трактора) является предпочтительным, поскольку он позволяет регулировать производительность насоса в соответствии с требуемым объемом внесения, используя селектор режима ВОМа. Кроме того, при более низком режиме насоса экономится мощность трактора.

JOSKIN устанавливает в основном вакуумные насосы с подвижными пластинами, приводимыми эксцентрично расположенным ротором, который всегда вращается в одну и ту же сторону. Нагнетаемый поток воздуха проходит сквозь коммутирующую заслонку, благодаря которой выбирается либо функция наполнения, либо нагнетания. Все насосы обеспечивают эквивалентное разряжение, какой бы ни была модель и производительность. Таким образом, нужно брать в расчет, сколько литров воздуха в минуту перекачивает насос. В компании JOSKIN предлагаются насосы производительностью в диапазоне от 4 000 до 15 000 л/мин. Основными моделями являются MEC производителя Battioni & Pagani, а также PN(E/R) марки JUROP. Все насосы имеют по меньшей мере покапельную смазку с заводской ручной или автоматической регулировкой. Смазка насоса происходит на фазах всасывания и нагнетания. Масло JOSKIN Vacuumoil, 5-литровая канистра с которым поставляется с каждой цистерной с вакуумным насосом, было специально разработано для лопаток насосов.

Все цистерны JOSKIN с вакуумным насосом укомплектованы предохранительным клапаном избыточного давления в цистерне, откалиброванным на + 1 бар. Если давление в цистерне превышает порог, пружины сжимаются, верхняя крышка клапана поднимается и давление резко падает. Как только последнее опустится ниже 1 бара, крышка возвращается в изначальное положение благодаря возвратным пружинам.

Самоочищающийся сифон (объемом 30 или 60 л) играет роль дополнительного предохранительного устройства между насосом и цистерной. Его конструкция предусматривает автоматическую очистку, когда воздух нагнетается в цистерну. Для облегченного обслуживания сифоны укомплектованы сливной пробкой.

Эко-очиститель, доступный объемом 30 и 60 л, объединяет Ecopump и сифон, сочетая характеристики и преимущества каждого из них. Его размеры значительно компактнее.

Вакуумный насос оснащён или механическим, или гидравлическим реверсом. Последний позволяет сделать выбор между фазами «всасывание» и «нагнетание». Гидравлическое управление необходимо для использования таких всасывающих орудий как насосный рукав JUMBO или верхняя стрела. В этом случае, реверс насоса осуществляется из кабины трактора для выбора фаз всасывания или нагнетания.